L'importance de la vallée résonne jusque dans les temps antiques comme en témoignent les vestiges de cette voie romaine.
La situation de la vallée fait du col de Jougne un point de passage à travers le Jura qui fut utilisé dès l'époque romaine pour relier Lausanne et Orbe à Pontarlier et Besançon alors appelées respectivement Ariolica et Vesontio.
Cette route servit par la suite, et ce jusqu'au 19e siècle, pour le transport du sel depuis les salines de Salins-les-Bains et d'Arc-et-Senans vers Berne et la Suisse romande.